基因分型芯片-Illumina小鼠和人的连锁分析
连锁分析芯片是进行疾病连锁分析的最佳工具，可以从家系基因型表现型和单基因型连锁不平衡中发现连锁关系。人类连锁分析芯片实验表明其成功率为99.8%，重复性>99.9%。
Affymetrix Plasmodium/Anopheles Genome Array 疟原虫
该芯片包括约4,300 Plasmodium falciparum 的转录子和约14,900 Anopheles gambiae 转录子。
肿瘤转移基因表达PCR芯片
肿瘤转移PCRArray可以同时检测已知的参与肿瘤转移的84个基因的表达。芯片所选的基因编码以下几类蛋白因子：细胞黏附、ECM成分、细胞周期、细胞生长和增殖、凋亡、转录因子和调节子以及其他一些转移相关因子。
Affymetrix Canine Genome 2.0 Array 狗
该芯片可以检测18,000个犬的mRNA/EST转录子，和超过20,000个非冗余的预测基因。